甲真菌病又称灰指甲。病因是丝状真菌、酵母样菌及酵母菌等真菌侵犯所致。已确定白色念珠菌及短帚霉菌可致感染，其他念珠曲菌、黄曲菌、烟色曲菌、淡灰曲菌、聚多曲菌、焦曲菌、杂色曲菌、头孢子菌。尖镰孢菌等均可致病。念珠菌中除白色念珠菌外，近年发现平滑念珠菌等也常可致甲真菌病。
由白色念珠菌引起的甲癣多并有甲沟炎，起于两侧甲皱襞，可有少量积脓，其上皮肤发红、肿胀和压痛。甲附近变为暗色，隆起，并与下面甲床分离，整个甲板也被渐渐波及。指甲较趾甲更易受染，多见于家庭主妇、炊事员及经常接触水的人。甲板不像毛癣菌感染那样变软、发黄或发白，仍如正常甲板那样发硬、发亮。短帚霉菌等有时亦可引起甲真菌病，在甲板下可有大量碎屑。
短帚霉菌引起的甲真菌病，在甲内可找到分生孢子。念珠菌性甲真菌病可伴慢性甲沟炎，引起甲的结构发生破坏，并伴有慢性炎症反应。酵母菌所致者，在甲及其疏松组织中找到相应真菌。其他真菌所致者在甲沟及甲床内有碎屑，切片可见其中有菌丝。
念珠菌可引起甲床炎和甲沟炎，同时能引起指(趾)甲的改变，甲床炎和甲沟炎可持续或间断性发作，发作时出现红肿、疼痛，但与细菌引起的甲床炎、甲沟炎不同，念珠菌引起者疼痛较轻，且不形成脓液，与发作同时逐渐出现患指(趾)的甲改变。
念珠菌甲病可并发指(趾)间糜烂，而甲癣患者则可并发手癣、脚癣或趾甲癣。前者多系从事与水接触较多的工作者，如洗衣工人、罐头食品工人、厨师或美容美发者，而后者则与职业无关。
念珠菌性甲病变的特别是混浊、变厚、变硬、变色，表面可有横沟，与皮肤癣菌所引起的甲癣有明显区别。念珠菌性甲病变虽有变色增厚等改变，但不同的是甲表面光泽尚存。
念珠菌性甲病变表面的横沟标志着甲床炎和甲沟炎的发作，每发作一次形成一道横沟，发作严重时横沟宽而深，发作轻微时横沟也轻微，发作时所造成的这种甲损害，随甲的生长而向远端推移，往往可以根据横沟所在位置，推断出若干时日前曾有甲沟炎发作。皮肤癣菌引起的甲沟、甲附近皮肤及甲板的病变为持久性的，不出现横沟。
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